在Django中出现TypeError("source and target must be of type SpatialReference")的原因是非空间参考对象传递给应该接受空间参考对象的函数或方法。解决方案包括确保正确的空间引用、检查对象类型、进行空间引用转换等。具体例子中展示了正确处理空间参考的步骤和避免错误的方法。